不，圣斗士星矢教皇没有干掉双鱼座。

《圣斗士星矢》作为一部著名的动漫作品，主要讲述的是一群拥有各自守护星座力量的圣斗士们与邪恶势力进行斗争的故事。在故事中，每个圣斗士都有自己所属的星座，并搭配着不同的穿戴服装和武器来展现出属于自己的独特风格。

而双鱼座则是其中一个非常受欢迎的星座，其代表着着浪漫、梦幻和神秘等富有魅力的元素。在《圣斗士星矢》的故事中，双鱼座的圣斗士是米洛，他是一位既聪明又狡猾的角色，经常借助自己的影响力和力量来达到自己的目的。

然而，在故事中，米洛最终并没有被教皇干掉。相反，教皇最终被圣斗士们打败，并为自己的所作所为承担了应有的惩罚。教皇的失败也标志着邪恶势力的终结，圣斗士们为人类的和平与正义而奋战的形象得到了极大的传承和呈现。

在整个故事中，圣斗士们和教皇的战斗并不局限于某个星座，而是全方面的进行斗争和交锋。故事情节的展开也更加注重情感和情节的深入挖掘，强调了圣斗士们在严峻的斗争中所展现出的勇气和热血。

在这个过程中，每个星座的圣斗士都有不同的展现方式和颜色。而其所代表的星座也给观众带来了丰富的视觉和心理体验。而教皇作为邪恶势力的代表，更是在故事中扮演了重要的角色，其所对抗的方向正是圣斗士们所期待的正义和和平。

因此，圣斗士星矢教皇并没有干掉双鱼座，而是在全方面的斗争中展现出了他作为邪恶势力代表所具有的一切。在这个过程中，圣斗士们的揭示和斗争成为了全体观众所关注的焦点，而教皇则成为了正义和和平的代表。